El equipo senior empezó a competir en la extinta 2ª división masculina (actual 1ª Nacional). Tras 10 temporadas en esa categoría, la posibilidad de ascender era inmejorable cuando se le concedió a Molina la organización de la fase de ascenso a Liga EBA. Del 27 al 31 de mayo de 1998 se vivió algo especial cuando equipos como San Patricio, L’Alcora, Cuenca, Casvi, Godella, Alcorcón, CABA y ADM, se disputaban 3 plazas en la siguiente edición de la EBA. Después de ganar el primer partido a Alcorcón, el ADM perdió ante CABA y Godella, no entrando de esta forma en semifinales. Finalmente fueron estos dos equipos más L’Alcora los que subieron. Jugadores como Javi García, Pedro Manzano, Ramón Fernández, Jordi Molina, Miguel Polo, Cuco Lázaro, Rafa Callado, Joaquín Gangoso, etc, no pudieron lograr hacer el sueño realidad y dejaron a la numerosa afición que pobló el Serrerías con la miel en los labios. Se consiguió la sexta plaza.

No pudo ser ese año, pero sí al siguiente. El equipo, nuevamente entrenado por Domingo Hernández, dio lo máximo en Castellón. Después de hacer una liga regular envidiable, superó al anfitrión (Cerámicas Gaya) en el debut y también en la final de esa Fase de Ascenso, consiguiendo un hito en el baloncesto molinense. A algunos de los jugadores del año anterior se sumaban hombres tan importantes como Carlos Peñafiel, Samuel Garrido o Albert Berenguer. El autobús de aficionados que se desplazaron hasta La Plana, celebró el éxito a lo grande con su equipo. Era 1999.

Tres meses después, con las incorporaciones de Quini García y Godwin Owinje se produjo el debut en Liga EBA. El rival era el CABA de Albacete, al que se superó por 88-67. Líderes!! Se mantendría ese liderato (ganando a Monzón, Castellón y Godella) hasta la jornada 5ª, donde Dènia hizo despertar del sueño a los molinenses, tras ganar por un solo punto en Molina. Finalmente, la temporada acabó siendo normal (9º puesto), pero fue uno de los años que más se disfrutó del baloncesto en Molina.

En la temporada 2000/01, el equipo se renovó. Llegaron los hermanos Arias (Braulio y Rafa) y un americano llamado Antonio Phillips, que dejó mejor imagen que Owinje. Sin embargo, el inicio fue un tanto desalentador, perdiendo los tres primeros partidos, lo que hizo ir al equipo a remolque durante buena parte de la liga. A falta de 4 jornadas, Archena ganaba al ADM y los aficionados archeneros mandaban ya a Molina al pozo. En la siguiente jornada, Molina perdía en casa con Huesca lo que casi confirmaba la triste noticia. Además, la directiva cesó a Domingo Hernández como entrenador local y cedió el testigo a Antonio Moret. Solamente un milagro valía y se produjo. El ADM ganó los dos últimos partidos y dependía del Paterna-Montemar de la última jornada. El partido en Molina terminó un par de minutos antes que el que se jugaba en La Salle y todos quedaron pendientes de un móvil. Montemar debía ganar… y lo hizo con un triple en el último segundo de Joaquín Gangoso, precisamente ex – jugador molinense. Fue un momento de esos de los que raramente se repiten en la grada, en el vestuario, en la cancha…

En la 01/02, Cartagena se unía a Archena y ADM en EBA. José David Costa debutaba en Molina, junto con Adrián Suárez y Foster Blake, entre otros. La temporada no fue excesivamente destacable pero tampoco se pasaron los apuros del curso anterior. Se obtuvo un 10º puesto y Moret hizo debutar a muchos canteranos en los últimos partidos.

El año siguiente (02/03) fue el del descenso, tras varios años jugando con fuego. Jugadores como Javi Marcos, Jaime Sánchez, Lisandro Beck o Carlos Dorrio nada más pudieron hacer por salvar al equipo. El equipo volvía al “infierno” y la sensación de escepticismo por ver qué ocurriría a partir de entonces era la que predominaba.

La directiva encargó el reto del ascenso a José Antonio Meseguer, que dos años antes, había conseguido el Campeonato Regional con el equipo junior entre otros muchos logros. Meseguer optó por conjuntar una mezcla de juventud (Mateo Alajarín, Óscar Hernández, Jaime Sánchez, José Juan Piqueras, David Costa, Israel Bastida…) con gente más experimentada (Javi García, Peñafiel, Heredia, Chicano, etc.) que dio un fruto excelente. Tan solo Villarreal fue capaz de terminar por delante y ambos equipos consiguieron ascender a Liga EBA. Era el esperado regreso pero esta vez sin hacer tanto ruido.

La temporada 04/05, el entrenador contratado fue Javier Aguilar, que con apenas 25 años, llegaba de dirigir a Archena la temporada anterior, aunque se formó en las categorías inferiores del ADM. Después de una pretemporada no muy tranquilizadora, consiguió ganar los 3 partidos iniciales de liga, lo que empezó a llevar más gente al pabellón Serrerías. El juego del equipo era además muy vistoso, basándose en la defensa y corriendo mucho al contraataque. Los fichajes (Juan Murillo, Álex González, Manu Conde) dieron, en líneas generales, buenos resultados.

La temporada 05/06, la directiva presidida por D. Joaquín Gª Box hizo un gran esfuerzo por conformar un equipo más potente. Fichajes como los de Xavi Alarcón, Dani Fernández o Jorge Navas colocaron al Grupo Inerzia ADM entre los aspirantes a optar a las 3 plazas que daban acceso a la Fase Final. Por contra, el capitán Javier García Cerezo dejaba el equipo (el año pasado recibió la insignia de oro del club).

Especial fue la campaña 06/07. Tras los fichajes de Ramón Moya, Jose Serrano, Goyo Domínguez, Damián García... el equipo aspiraba a acabar arriba  pero el inicio fue desalentador con dos derrotas consecutivas. Posteriormente fueron escalando posiciones hasta entrar terceros, en dura pugna con L'Alcora. En el cruce previo, se ganó al Domo Oviedo. En la final a 8, Jorge Navas estuvo espléndido contra el CB Navás y metió a su equipo en semifinales. El partido decisivo era contra Illescas, un auténtico equipazo. No se pudo conseguir el logro pero hasta el minuto 35 el partido estuvo igualado. El buen hacer y el apoyo de la afición, dieron como fruto la entrada en la nueva LEB Bronce.

Afición que se mantendría e incrementaría en la temporada 2007/08. El club se profesionalizaría, con jugadores plenamente dedicados al baloncesto, contratos en la seguridad social y con un gabinete de prensa, con el objetivo de hacerse un hueco en el panorama nacional. Se mantenía Clemmons en el equipo y llegaban como foráneos Rakim Hollis y Ed Dotson. Éste no tuvo suerte con las lesiones y fue reemplazado por Hamilton y luego por Hooks, que tampoco acabó la temporada. El sabor de boca final fue un tanto agridulce, ya que después de un inicio tremendo, con liderato incluido y final de Copa, el equipo acabó 7º y perdió en cuartos de final contra el Unibasket Jerez.